Turk diplomasisinin onemli sorunları arasında yer alan Ermeni soykırımının tanınması konusu da gundemdeki yerini korudu. Kanada parlamentosunun Ermeni soykırımı nı tanıması Ankara da buyuk tepkiyle karşılandı. Ermeni diyasporası Slovakya parlamentosundan da bu yonde bir onerge cıkarttı. Ama Turkiye icin asıl sıkıntı yaratan oneri Fransa dan geldi. 2002 de soykırımı parlamento kararıyla tanıyan Fransa da Dışişleri Bakanı Michel Barnier Turkiye ile AB arasındaki muzakerelerde Ermeni soykırımı konusunu da gundeme getireceklerini ilan etti. Bu konu Avrupa Parlamentosu nun 16-17 Aralık AB zirvesi oncesinde kabul ettiği ve Turkiye ye buyuk destek verdiği raporunda da puruz olarak yer aldı. Ekumen krizi eksik olmadı 2004 yılının sonuna doğru Turk dış politikasını meşgul eden bir başka sorun da Fener Rum Patriği Bartholomeos un ekumenik unvanının vurgulanarak Amerikan Buyukelcisi Eric Edelman tarafından verilen bir resepsiyona davet edilmesi oldu. Ankara Rum cemaatinin sembolik ve tarihsel bir onem atfettiği ekumenik unvanının Amerikan elcisi tarafından kullanılmasına sert tepki verince bir kriz patlak verdi. Başbakan Tayyip Erdoğan AKP li milletvekilleri ve ust duzey yoneticilere bizzat resepsiyonu boykot etmeleri icin talimat verdi. Ancak Amerikan yonetimi bu konuda geri adım atmadı. ABD Dışişleri Bakanlığı bu boykotu not ettikleri acıklaması yaptı